Do ta chưa biết 2 locut thuộc các NST khác nhau hay cùng nằm trên cùng 1 NST nên ta sẽ phải tính cả 2 trường hợp. Tuy nhiên, cây thân thấp, hoa đỏ chỉ trội về 1 locut còn locut còn lại toàn lặn nên ta coi như đây là phép lai về 1 locut duy nhất (màu hoa) do đó dù phân li độc lập hay liên kết gen thì kết quả cũng sẽ giống nhau. Do đó, ta chỉ cần tính 1 trường hợp là đủ (tính theo phân li độc lập). Cây thân thấp, hoa đỏ có 2 loại kiểu gen là aaBB và aabb. Chọn 3 cây thân thấp, hoa đỏ tự thụ sẽ có 4 trường hợp khác nhau:

+) TH1: 3 cây được chọn là aaBB. ⇒ Đời con cho 100% aaBB (thân thấp, hoa đỏ).

+) TH2: 3 cây được chọn có 2 cây aaBB và 1 cây aaBb. ⇒ Đem các cây tự thụ có:

\(\frac{2}{3}aaBB \Rightarrow \frac{2}{3}aaBB\)

\(\frac{1}{3}aaBB \Rightarrow \frac{1}{3}\left( {\frac{3}{4}aaB - :\frac{1}{4}aabb} \right) = \frac{1}{4}aaB - :\frac{1}{{12}}aabb\)

⇒ Đời con cho tỉ lệ kiểu hình là:

Thân thấp, hoa đỏ \(\left( {aaB - } \right) = \frac{2}{3} + \frac{1}{4} = \frac{{11}}{{12}}\)

Thân thấp, hoa vàng \(\left( {aabb = \frac{1}{{12}}} \right)\)

+) TH3: 3 cây được chọn có 1 cây aaBB và 2 cây aaBb. Đem các cây tự thụ có: 

Thân thấp, hoa đỏ \(\begin{array}{l} (aaB - ) = \frac{1}{3} + \frac{1}{2} = \frac{5}{6}\\ \end{array}\)

Thân thấp, hoa vàng \((aabb) = \frac{1}{6}\)

+) TH4: 3 cây được chọn đều có kiểu gen aaBb.

Đem tự thụ có: \(aaBb \Rightarrow \frac{3}{4}aaB - :\frac{1}{4}aabb\)

⇒ Tỉ lệ kiểu hình là 3 thân thấp, hoa đỏ : 1 thân thấp, hoa vàng.

Vậy có (1), (2), (3) và (4) thỏa mãn.